Nukleotid je organski spoj koji nastaje dušikovom bazom, šećerom i fosfornom kiselinom . Moguće je podijeliti nukleotide na ribonukleotide (kada je šećer riboza) i dezoksiribonukleotide (ako je šećer dezoksiriboza).
Ne-nukleinski nukleotidi su vrlo važni za biologiju, kao i oni koji su dio nukleinskih kiselina. Oni slobodno nastanjuju stanice i sudjeluju u njihovom metabolizmu i, kao aktivatori enzima, reguliraju ih, osiguravajući im kemijsku energiju tijekom reakcija. Jedan od njih, ATP, spominje se u prethodnim odlomcima.+ Adeninski nukleotidi
ATP i ADP su važni nukleotidi za biologiju, budući da su veze koje čine fosfatne skupine vrlo bogate energijom (zapravo su to molekule koje su posvećene prijenosu energije), koje se akumulira u trenutku njihovog sjedinjenja i Lako se oslobađa kada se veza razbije hidrolizom.
Osim što je jedan od dva najvažnija transportera energije, ATP je vrlo svestran element u raznim energetskim razmjenama: polazeći od fosforne kiseline i ADP (fosforilacija), ATP se stvara energijom koja se oslobađa tijekom egzergonskih reakcija (karakterizira ih za prikazivanje negativne varijacije Gibbsove slobodne energije); Kada se desi defosforilacija, to jest, ATP se hidrolizira (interagira s vodom i modificira njegovu strukturu) na fosfornu kiselinu i ADP, energija koja se oslobađa iz tog procesa služi za njegovanje endergonskih reakcija (slobodna energija Gibbsa predstavlja varijaciju pozitivan).
+ Koenzimski nukleotidi
Koenzimi su ne-proteinske organske molekule koje sudjeluju u enzimatski kataliziranim reakcijama, tijekom kojih su obično odgovorne za prijenos elektrona. Veliki broj tih koenzima su nukleotidi, iako postoje i u drugim klasama. Suprotno enzimima, oni ne ovise o određenom tipu supstrata koji djeluje na danu reakciju.
Nukleotidi flavina, na primjer, su FMN (flavin-mononukleotid, u kojem postoji spoj između fosfatne skupine i flavina) i FAD (flavin-adenin-dinukleotid, koji je formiran od strane molekule FMN vezan preko fosfodiesterske veze s jednim od AMP), su koenzimi, i mogu biti u oksidiranom obliku (s upravo spomenutim imenima) ili reduciranim (pod imenima FMNH2 i FADH2).